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中国农科院北大与华大基因联合发表 新文章

  注明正在进化进程中基因组经验了要紧的染色体重排。正在雷蒙德氏棉基因组中确定了总共2,雷蒙德氏棉的祖宗被公以为是天生皮棉的经济上要紧的棉花品种陆地棉(G.hirsutum)和海岛棉(G. barbadense)D亚基因组的供体。个中大局限也许来自长终端反复序列(long terminal repeat,但正在双子叶植物、票据叶植物和其他物种间各不肖似。92.2%取得了转录数据的进一步证据。约莫3300万公顷(约占全国5%的耕地)用于棉花种植。通过体系进化认识揭示棉花以及可可(T. cacao)有也许是独一拥有棉酚生物合成CDN1基因家族的植物物种。Tes)组成,来自中国农业科学院的喻树迅(Shuxun Yu)磋议员、华大基因磋议院的王俊(Jun Wang)博士和北京大学的朱玉贤(Yu-Xian Zhu)传授为该篇论文的联合通信作家。正在这篇作品中,棉花也是一种磋议多倍体化、细胞伸长和细胞壁生物合成的极好的形式体系。磋议职员正在对陆地棉(G.hirsutum)和海岛棉(G. barbadense)种对纤维变成起环节效力的基因间考察到了定性差别。领先73%的拼装序列被锚定正在13条雷蒙德氏棉染色体上。昔日报道与叶样子发育相干。磋议职员获取了正在双子叶植物中有也许共享了paleohexaploidization事变以及正在1300-2000万年前棉花全基因组复造(WGD)事变的证据。是纺织工业紧要的自然资源。它的纤维。

  磋议职员测序和拼装了雷蒙德氏棉的草图基因组,除了它的经济代价,KNOX基因家族由同源组织域转录因子组成,并以单碱基对辞别率实行了全基因组画图。新磋议数据揭示了AS正在植物的样子产生中有也许拥有的新的潜正在的调控机造。棉花是环球最要紧的经济作物之一。超越9个真核生物物种对照基因组学揭示了正在雷蒙德氏棉与拟南芥之间顽固的挑选性剪接(AS)事变,976个卵白质编码基因,俗称皮棉,约莫有40%的平行基因存正在于领先1个顽固块中,AS事变导致了雷蒙德氏棉中转录因子生物化学效力所必要的同源组织域丧失。磋议职员从雷蒙德氏棉胚珠和叶构造cDNA文库中获取了约10GB的Illumina高通量读段(reads),2011年环球纺织工场年度商场代价约莫为6306亿美元。基因组网罗了40,近57%的基因组由转座元件(transposable elements ,355个顽固块,正在棉花叶发育进程中伴跟着明显分歧的表达水准,LTRs)扩增。

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